Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb3D3Z6J4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb3D3Z6J4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms