Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3676D3Z236 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3676D3Z236 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms