Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc170D3YXL0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc170D3YXL0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc170D3YXL0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms