Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Samd1D3YXK1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd1D3YXK1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd1D3YXK1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms