Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim30cD3YVI9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim30cD3YVI9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms