Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2d4D3YUH6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ube2d4D3YUH6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ube2d4D3YUH6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ube2d4D3YUH6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms