Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcb5B5X0E4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcb5B5X0E4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms