Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Polr3aB2RXC6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Polr3aB2RXC6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms