Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930402K13RikB1AW18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402K13RikB1AW18 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402K13RikB1AW18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402K13RikB1AW18 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402K13RikB1AW18 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402K13RikB1AW18 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930402K13RikB1AW18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930402K13RikB1AW18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930402K13RikB1AW18 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms