Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700042G07RikB1AUF7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700042G07RikB1AUF7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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