Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ttll11A4Q9F4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll11A4Q9F4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll11A4Q9F4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms