Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CatsperbA2RTF1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CatsperbA2RTF1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms