Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms