Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rtf1A2AQ19 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rtf1A2AQ19 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rtf1A2AQ19 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms