Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syndig1A2ANU3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syndig1A2ANU3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syndig1A2ANU3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms