Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GabreA2AMW3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GabreA2AMW3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GabreA2AMW3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms