Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zkscan16A2ALW2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan16A2ALW2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan16A2ALW2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms