Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SetxA2AKX3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SetxA2AKX3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SetxA2AKX3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms