Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms