Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930447F04RikA2AFR2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930447F04RikA2AFR2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930447F04RikA2AFR2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms