Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisal2aA2A9G7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms