Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Akap17bA2A3V1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Akap17bA2A3V1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Akap17bA2A3V1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms