Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms