Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Larp1bA0A0A6YXJ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms