Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700017N19RikA0A087WPJ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms