Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Syngr4Q9Z1L2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Syngr4Q9Z1L2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms