Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Psmb3Q9R1P1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms