Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms