Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms