Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3b2Q9JME5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms