Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms