Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp29Q9ES63 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp29Q9ES63 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp29Q9ES63 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp29Q9ES63 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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