Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SelenooQ9DBC0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SelenooQ9DBC0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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