Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MsraQ9D6Y7 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MsraQ9D6Y7 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MsraQ9D6Y7 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MsraQ9D6Y7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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MsraQ9D6Y7 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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MsraQ9D6Y7 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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MsraQ9D6Y7 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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MsraQ9D6Y7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MsraQ9D6Y7 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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