Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnot11Q9CWN7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms