Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atxn3Q9CVD2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Atxn3Q9CVD2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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