Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nsmce3Q9CPR8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms