Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gins4Q99LZ3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms