Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tspan1Q99J59 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms