Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CsprsQ99388 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms