Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MyripQ8K3I4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MyripQ8K3I4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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