Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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