Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Hpf1Q8CFE2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hpf1Q8CFE2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hpf1Q8CFE2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hpf1Q8CFE2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hpf1Q8CFE2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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