Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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