Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms