Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col6a6Q8C6K9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col6a6Q8C6K9 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col6a6Q8C6K9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col6a6Q8C6K9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col6a6Q8C6K9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col6a6Q8C6K9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Col6a6Q8C6K9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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