Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm11541Q8C4D8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm11541Q8C4D8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm11541Q8C4D8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm11541Q8C4D8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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