Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ttc21aQ8C0S4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ttc21aQ8C0S4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ttc21aQ8C0S4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ttc21aQ8C0S4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21aQ8C0S4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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