Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms