Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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